Между второй и третьей мировыми войнами прошло 20 лет
3 мировая война велась на территориях малых стран - Страны Травы, страны Дождя, страны Мороза.
События и итоги:

Коноха вела боевые действия против Камня, Облака и Тумана.
Песок принимал участие в войне, оберегая свои границы. Суна не могла воевать активно - таинственно исчез Третий Казекаге, самый сильный Каге за всю историю селения. Возглавил селение Раса. Сасори покидает селение, становясь отступником.

Коноха сражалась на два фронта и проигрывала. Были огромные потери в сражении с Третьим Райкаге. Минато дрался с Эем и Би. Кумо в итоге отступило.
Камень рвался на территорию страны Огня на другом фронте и  побеждал в каждом сражении. Минато перевернул ход войны и Селение Листа вышло победителем.
Обито отдаёт глаз Какаши, выживает и становится марионеткой Мадары.
Данзо убивает несколько членов клана Учиха и заполучает Шаринган. Орочимару проводит совместные опыты над телом Данзо

Война продолжается. Проходят месяцы.

Селение Тумана приобретает славу Кровавого Тумана.

Семерка мечников вступает в сражение с Майто Даем.
В битве погибают:
Обладатель Взрывного меча, обладатель Хирамекарей, Бива Джузо, Куриараре Кушимару, Акебино Джинин и Райга Куросаки. Фугаку Суйказан выживает и забирает все мечи с собой.
Сам Майто Дай также погибает после использования Восьми Врат.

Ао убивает члена клана Хьюга и имплантирует себе Бьякуган. Спустя тренировки и время он раскрывает страшную тайну - Мизукаге Ягура находится под контролем чьей-то техники.
Мей Теруми подбирает мальчика Хаку с улицы.

Суйказан Фугуки погибает от рук Кисаме.

Ягура освобождён из-под контроля, однако с поста Мизукаге снят, растеряв доверие. Новый Мизукаге - Мей Теруми. В Ягуру запечатывают Санби. Ягура потерял доверие селения и верных ему мечников. Он собирает новое поколение, продолжая влиять на внутреннюю и внешнюю политику селения Тумана.

Новый состав мечников:
Амеюри Ринго - обладательница клыков, Мунаши Джинпачи - владелец взрывного меча, Момочи Забуза - Кубикирибочо, Хозуки Мангецу - игла, Чоуджиро - Хирамекарей. Кабутовари свободен.

Обито узнает от Зетсу, что его друзья в беде и, выбравшись из пещеры, мчится к ним на помощь.
Обито успевает помочь друзьям, убивает всех противников. Троица возвращается в селение и все докладывает Хокаге.

Учиха Шисуи прогоняет отряд Ао от границ страны. Скрытый Туман сосредоточился больше на решении внутренних расприй и не лез на рожон.

Группы Акатсуки и Ханзо встречаются для соглашения. С помощью главы Корня АНБУ, Ханзо удается взять в заложники Конан. Переговоры оказались ловушкой. Нагато проявляет свою силу в полном объеме, убивая людей Данзо. После сражения на поле остаются не большие остатки людей Ханзо вместе с ним и Акатсуки Конан и Нагато. Яхико погибает от рук Данзо. Ханзо понял что перед ним стоит настоящий герой, боец каких мало и решает наблюдать за Нагато, нехотя помогая на первых порах. Теперь Селение Дождя сплоченное как никогда строит планы по нанесению удара по Конохе.

Рождение Наруто происходит по плану Третьего Хокаге. Без инцидентов.